Я обрабатывала перекисью и хлорфиллиптом. Зеленкой не стоит, потому что она красит (одежду тоже красит, кстати) и не видно, что там в пупке - все нормально или покраснело, воспалилось, сопрело... уже только по запаху будет понятно, если загниет. Так что смысла в ней нет, никакой пользы.
Марганцовка признана прекурсором (то есть, компонентом в данном случае) наркотиков, ее даже одно время по рецепту только продавали. Сейчас купить можно, но ее надо аккуратно разводить и процеживать - если хотя бы один кристаллик попадет на кожу, будет химический ожог. Но по своему опыту могу сказать, что применять ее можно разве что для промывания желудка (или болях) у подросших детей, для младенцев это вещество - ни уму, ни сердцу.